常用的抗生素中有许多是从霉菌提炼出来的，如青霉素、红霉素、金霉素、链霉素……等等，

有些霉菌却是有害的，如物体霉变； 有些霉菌是病原菌（真菌感染）； 黄曲霉素会致癌。

食品的发酵工艺、制酱、豆制品的发酵产品都是霉菌的功劳。