孟德尔由分离定律提出了三大问题：

（1）两对或多对相对性状在遗传过程中又是如何作用的呢？ （2）它们之间会互相干扰吗？ （3）多对相对性状的杂交结果是否也可以用分离定律来解释？

为此，孟德尔开始了两对（或多对）相对性状的杂交实验的研究。

他仍以豌豆为材料，选取两对相对性状：子叶的颜色（黄色和绿色）；种子的形状（圆形和皱形）。